Tujuan penyelenggaraan pendidikan Pascasarjana Unversitas Islam Lamongan adalah untuk :
- Menghasilkan lulusan yang professional dibidang keahlian sesuai program studi kompetensi penelitian dan pemahaman akademik baik Pendidikan, penelitian, pengabdian pada masyarakat dan publikasi ilmiah .
- Menghasilkan sarjana magister yang berkemampuan tinggi mengimplementasikan ilmu yang diperoleh baik tingkat lokal, nasional maupun internasional.
- Menghasilkan lulusan yang memiliki karya pascasarjana monumental dan berbudaya tinggi .